云计算待遇:【交流】Vector NTI 9.0功能介绍 =系列教程＝lifesc精品制作 (09

Part1: Vector NTI模拟电泳功能介绍
写在前面：
酶切分析和电泳技术是最最基本的，也是最最常用的分子生物学实验技术，我们几乎天天都在实验室做质粒的酶切鉴定，简单地说，就是使用合适的限制性内切酶将质粒切成不同大小的片段，然后通过Agarose电泳检测其大小是否与预期结果相符。
通常，我们都有质粒的序列，许多软件可以帮助我们找到酶切位点，我们可以根据这些信息选择合适的限制酶。知道了合适的酶切位点，就可以自己计算出酶切后的条带大小。
一些比较综合的分子生物学软件将这些工作直观而简化地帮我们解决了，能熟练地应用它们，会让你的工作更简单。个人比较喜欢使用Vector NTI，下面就介绍一下Vector NTI 9.0的模拟电泳功能，希望能抛砖引玉，大家写出更多更好的教程。
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当我们拿到一个质粒，准备对它进行酶切鉴定时，如果上面的酶切位点密密麻麻，要找到一个合适的切点，真是头晕～当然，你也可以让软件一个个地显示，然后去计算切出的片段大小，但仍然是件比较费时的事情。Vector NTI的模拟电泳功能可以让这件事情容易些，更重要的是，你选择质粒序列，限制酶，它直接告诉你酶切结果在胶上跑出来会是什么样子，每条带多大。简便，直观。


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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。 lifesc edited on 2009-03-10 22:03
罗氏I型高效地高辛DNA标记和检测试剂盒(生色法)
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2007-09-09 20:12引用 分享 分享到哪里？
创建模拟电泳


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用解决方案超越进口品牌，海尔超低温冰箱在上海新华医院中标
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2007-09-09 20:14引用 分享 分享到哪里？
点击Gel，选择Creat new。。。。


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2007-09-09 20:15引用 分享 分享到哪里？
会弹出一个对话框 Gel Setup，可以对各种参数进行设置。这里，我们就按默认值，确定就可以了。


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基因敲除小鼠骨髓祖细胞
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2007-09-09 20:17引用 分享 分享到哪里？
下一步就是上样。点击Gel-Creat gel sample或者选择红色方框所示的图标，都可以。


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2007-09-09 20:27引用 分享 分享到哪里？
在弹出对话框中，可以自由地选择分子（质粒或DNA片段），限制酶。
分子和酶的选择无数量限制，因此可以满足任何情况，多个酶切同一分子，多个酶切多个分子等等。
1. 在这个列表框中，可以看到你数据库里面的DNA分子，你可以双击选择，被选择的分子显示在右边的Molecule框内，你也可以双击取消。可以同时选择多个。
2. 在这里，你可以选择你数据库内存在的限制性内切酶，你可以自己创建新的酶（以后介绍），双击选择，被选中的酶显示在右边的Enzymes框内。可以同时选几个。
3. Add to Gel上样，可以上多个样。
4. 上样完毕后，Close。


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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。
细胞学检测套餐三
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2007-09-09 20:27引用 分享 分享到哪里？
这是上样后的界面如下：


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复旦大学生命科学学院招聘研究助理
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2007-09-09 20:31引用 分享 分享到哪里？
当然，也可以创建自己需要的Marker，如图所示：选择Gel-Creat gel marker


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供应ELISA试剂盒-人——上海博谷
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2007-09-09 20:32引用 分享 分享到哪里？
弹出对话框用于详细信息的设定：
在General选项卡中，输入Marker的名称，我们以DL2000为例


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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。
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2007-09-09 20:34引用 分享 分享到哪里？
在Gel marker选项卡，可以输入Marker 各条带大小，Add添加。
基本上，我们只需要设定成这样就行了，确定。


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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。
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2007-09-09 20:36引用 分享 分享到哪里？
点击图中的红色方框内的图标，就可以进行Marker上样喽。。。。。。
在弹出的窗口里，有我们数据库内所有的DNA Marker，看到没DL2000就是我们刚刚输入的，赶快选来用用～


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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。 lifesc edited on 2007-09-09 22:07
供应向伯豪用户开放在线分析系统——SBC Analysis System, SAS系统
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2007-09-09 20:39引用 分享 分享到哪里？
左边的红色方框内，告诉我们每个泳道每条带的大小。
右边的模拟出在胶上，这些条带的分布情况。


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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。 lifesc edited on 2007-09-09 22:11
?【共享】考博英语之—全国医学博士英语统考英语（完形篇）
danking1983

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2007-09-10 11:12引用 分享 分享到哪里？
不错，占个位置学习学习！
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2007-09-10 18:45引用 分享 分享到哪里？
谢谢版主的鼓励！
下一步准备做个Vector NTI分析核酸序列的教程，现在正在构思怎么做。
希望能对序列分析方面的新手有所帮助！
谢谢热心战友支持 ！
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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。 liuzeyi2002 edited on 2007-09-10 20:08
罗氏NimbleGen人比较基因组杂交12x135K全基因组叠片式v3.0芯片服务
HaveNoMoney

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2007-09-12 19:58引用 分享 分享到哪里？
号贴,顶!!!!!
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dqishere

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2007-09-13 08:36引用 分享 分享到哪里？
感激不尽！谢谢！
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2007-09-13 21:14引用 分享 分享到哪里？
Part2：核酸序列的输入与简单编辑（功能介绍）
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为了让所有人都能看明白，就从最基本的功能开始介绍吧～这次介绍怎么输入序列和进行简单的序列编辑。
偶先把图贴上来，接着再写文字说明，如有错误或表述不清，希望大家能及时提出，批评指证，谢谢！


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经典是对经典的继承，经典是对经典的背叛。 lifesc edited on 2007-09-13 21:50
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2007-09-13 21:16引用 分享 分享到哪里？
这是Vector NTI的启动界面


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2007-09-13 21:17引用 分享 分享到哪里？
创建新的序列


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2007-09-13 21:17引用 分享 分享到哪里？
也可以通过这种方法直接从数据库下载序列


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2007-09-13 21:19引用 分享 分享到哪里？
我们选择上一种，Creat New Sequence－Using sequence Editor DNA/RNA后，会弹出这样的对话框，先输入名称：TEST


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2007-09-13 21:20引用 分享 分享到哪里？
点击Sequence and Maps后，会出现如下界面：


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xTAG? 呼吸道病毒快速检测试剂盒
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2007-09-13 21:22引用 分享 分享到哪里？
选择Edit Sequence，在弹出窗口中，我们就可以将从其它地方复制的序列直接Ctrl+V粘贴上去，可以是文本，也可以是FASTA等序列格式。


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2007-09-13 21:23引用 分享 分享到哪里？
选择OK后，弹出提示，确定。


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2007-09-13 21:24引用 分享 分享到哪里？
这是序列输入后的界面，也是Vector的工作界面：


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2007-09-13 21:26引用 分享 分享到哪里？
右键单击名称TEST，可以对Molecule属性进行设定。


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2007-09-13 21:27引用 分享 分享到哪里？
红色方框内的便是对分子属性进行详细设定的各选项。


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2007-09-13 21:28引用 分享 分享到哪里？
从这里开始添加或减少显示酶切位点。


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2007-09-13 21:30引用 分享 分享到哪里？
选择Restriction sites后的弹出窗口，这里可以添加或删除酶切位点，我们只演示怎么添加，删除也一样操作。


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2007-09-13 21:33引用 分享 分享到哪里？
单击添加，可以从列表中选择相应的酶，可以多选。


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2007-09-13 21:34引用 分享 分享到哪里？
怎么在序列上面添加标记呢？
先选择一段序列，再按如下操作。。。


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2007-09-13 21:36引用 分享 分享到哪里？
左边是标记的类型，右边是名称：


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HQ0050-甲酰胺/氨基甲醛/Formamide——上海华壹
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2007-09-13 21:36引用 分享 分享到哪里？
添加后的效果，从图上直观地反应出来。


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2007-09-13 21:38引用 分享 分享到哪里？
图谱与序列是相关联的，对序列的操作可以在图上看到，对图谱的操作也同时在序列上面反映。


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蛋白纯化服务
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2007-09-13 21:39引用 分享 分享到哪里？
怎么修改图谱的显示特性呢，比如形状颜色什么的？
在图谱上面单击（激活这个区域），然后按如下操作：


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